Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnep1r1Q3UJ81 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnep1r1Q3UJ81 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms