Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf224Q3UIW8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms