Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms