Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsph3aQ3UFY4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rsph3aQ3UFY4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsph3aQ3UFY4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms