Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trafd1Q3UDK1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trafd1Q3UDK1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms