Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip13Q3UA06 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip13Q3UA06 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms