Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cops9Q3U898 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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