Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VwceQ3U515 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VwceQ3U515 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms