Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2bQ3U0J8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d2bQ3U0J8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms