Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pbxip1Q3TVI8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pbxip1Q3TVI8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms