Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms