Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calr4Q3TQS0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms