Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c3Q3TMP1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c3Q3TMP1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms