Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Smarca4Q3TKT4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Smarca4Q3TKT4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smarca4Q3TKT4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms