Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc13Q3TIR1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms