Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp444Q3TDV8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp444Q3TDV8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp444Q3TDV8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms