Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem104Q3TB48 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem104Q3TB48 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms