Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VrtnQ3SYK4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VrtnQ3SYK4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VrtnQ3SYK4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms