Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Prr27Q3SYJ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr27Q3SYJ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms