Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riiad1Q3KNY5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riiad1Q3KNY5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms