Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4dQ2MDG0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox4dQ2MDG0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms