Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms