Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne9Q1RLL3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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