Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Perm1Q149B8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Perm1Q149B8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms