Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klrb1Q0ZUP1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klrb1Q0ZUP1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms