Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp2b3Q0VF55 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2b3Q0VF55 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2b3Q0VF55 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms