Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r181Q0P547 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r181Q0P547 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r181Q0P547 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms