Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kcnma1Q08460 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnma1Q08460 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnma1Q08460 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms