Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata4Q08369 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms