Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AmbpQ07456 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AmbpQ07456 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms