Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cntn3Q07409 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn3Q07409 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms