Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrstQ06666 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrstQ06666 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms