Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnal1Q05A62 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnal1Q05A62 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms