Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SryQ05738 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SryQ05738 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SryQ05738 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SryQ05738 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SryQ05738 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SryQ05738 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SryQ05738 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SryQ05738 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SryQ05738 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SryQ05738 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SryQ05738 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SryQ05738 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SryQ05738 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SryQ05738 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SryQ05738 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SryQ05738 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SryQ05738 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SryQ05738 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SryQ05738 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.7 ms