Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoc2Q05020 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms