Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms