Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msx2Q03358 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms