Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax5Q02650 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax5Q02650 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax5Q02650 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax5Q02650 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax5Q02650 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax5Q02650 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms