Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RykQ01887 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RykQ01887 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RykQ01887 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RykQ01887 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RykQ01887 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RykQ01887 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RykQ01887 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RykQ01887 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RykQ01887 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RykQ01887 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RykQ01887 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RykQ01887 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms