Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23aQ01405 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec23aQ01405 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms