Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Grin2bQ01097 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Grin2bQ01097 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Grin2bQ01097 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Grin2bQ01097 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms