Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4dQ01063 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4dQ01063 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4dQ01063 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4dQ01063 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde4dQ01063 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pde4dQ01063 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde4dQ01063 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms