Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F8a1Q00558 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8a1Q00558 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8a1Q00558 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms