Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad5P97454 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad5P97454 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms