Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smyd1P97443 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smyd1P97443 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms