Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SmsP97355 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SmsP97355 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SmsP97355 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SmsP97355 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SmsP97355 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SmsP97355 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SmsP97355 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SmsP97355 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SmsP97355 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SmsP97355 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SmsP97355 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SmsP97355 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SmsP97355 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SmsP97355 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SmsP97355 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SmsP97355 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SmsP97355 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SmsP97355 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SmsP97355 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SmsP97355 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SmsP97355 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SmsP97355 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms