Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx2-3P97334 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx2-3P97334 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx2-3P97334 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms