Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nucb2P81117 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nucb2P81117 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nucb2P81117 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nucb2P81117 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nucb2P81117 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nucb2P81117 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nucb2P81117 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb2P81117 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb2P81117 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb2P81117 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nucb2P81117 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms