Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tp53bp1P70399 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tp53bp1P70399 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms