Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tgif1P70284 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tgif1P70284 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms